Специализированная клиническая детская инфекционная больница располагается на территории в 4 га, в зеленой зоне, на улице Красных Партизан. Сюда осуществляется госпитализация пациентов с инфекционными заболеваниями. В состав больницы входят семь боксированных инфекционных отделений, туберкулезное отделение. Дети с неконтактными заболеваниями, состояние которых не требует экстренной госпитализации, проходят лечение в консультативно-диагностическом отделении.