Образовательная структура в медресе настроена не только на изучение наук, но и на достойное воспитание. Не считая фундаментальных разделов обучения, составленных на основе базисного учебного плана, коллектив учителей уделяет внимание на индивидуальное развитие учащегося. Учеба в медресе Медина не ограничивается только занятиями в стенах здания — ученики принимают участие в различной внеклассовой работе. Мудрые наставники, уникальная обстановка занятий, доброжелательные отношения создают благоприятную среду для всестороннего развития человека.